少年「焰莲」在某天回到了以往曾居住过的城市「神之原」，但他虽然走在熟悉街道上，却感受到一股不知名违和感且无法回想起过往记忆……突然之间，焰的手机被强迫安装未知名游戏「怪物弹珠」，并从中飞出各式怪物展开战斗。伴随着超次元的发展，焰隐约发现隐藏在记忆深处的秘密就是一切关键。究竟在一众伙伴及怪物们帮助下，真实之门是否会向他开启呢？